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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  37 lines
  1. *********************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 32 active site *
  3. *********************************************
  4.  
  5. It has been shown [1,2] that  the following glycosyl hydrolases can be, on the
  6. basis of sequence similarities, classified into a single family:
  7.  
  8.  - Inulinase (EC 3.2.1.7) (or inulase) from the fungi Kluyveromyces marxianus.
  9.  - Beta-fructofuranosidase (EC 3.2.1.26), commonly known as invertase in fungi
  10.    and plants and as sucrase in bacteria (gene sacA or scrB).
  11.  - Raffinose invertase (EC 3.2.1.26) (gene rafD) from Escherichia coli plasmid
  12.    pRSD2.
  13.  - Levanase (EC 3.2.1.65) (gene sacC) from Bacillus subtilis.
  14.  
  15. One of the  conserved regions in  these  enzymes is  located in the N-terminal
  16. section and contains an  aspartic acid  residue which  has been  shown [3], in
  17. yeast invertase to be important for the catalytic mechanism. We have used this
  18. region as a signature pattern.
  19.  
  20. -Consensus pattern: H-x(2)-P-x(4)-[LIVM]-N-D-P-N-G
  21.                     [D is the active site residue]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24.  
  25. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  26.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  27.  
  28. -Last update: December 1992 / Text revised.
  29.  
  30. [ 1] Henrissat B.
  31.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  32. [ 2] Gunasekaran P., Karunakaran T., Cami B., Mukundan A.G., Preziosi L.,
  33.      Baratti J.
  34.      J. Bacteriol. 172:6727-6735(1990).
  35. [ 3] Reddy V.A., Maley F.
  36.      J. Biol. Chem. 265:10817-10120(1990).
  37.